Daidalos se vrací zpět na Atlantis společně se členy expedice. Dr. McKay ale zjistí, že systémy Daidala byly infikovány wraitským virem, který nastavil kurs loďi k těsnému průletu kolem slunce. Má tak zabít radiací posádku a Wraithové pak Daidala použijí k letu za svou potravou na nové planetě Zemi...

Expedice při pátrání po por. Fordovi objeví štvance Ronana Dexe. Jeho fyziologie znemožňuje wraitům vysát z něj jeho životní sílu, a tak mu bylo do zad voperováno zařízení, pomocí kterého jej sledují a pak jej pronásledují. Za to že mu dr, Beckett zařízení odstraní, Ronan slibuje, že chytí Forda...

Dr. McKay a por. Cadmanová jsou náhle transportováni wraithskou stíhačkou. Ta je ale sestřelena. Energie ve stíačce však stačí pouze ke zhmotnění jednoho z nich. Dr. Zelenkovi se podaří zhmotnit dr. McKaye, ten ale zjišťuje, že své tělo sdílí spolu s vědomím por. Cadmanové...

Team mjr. Shepparda se vydává v puddle jumperu na průzkum další planety. Narazí na skupinu trestanců, která je ale po chvíli zahnána lodí a team je vzat do města. Zde se dozvídá, že díky trestancům je město již řadu let v bezpečí, protože se Wraithové krmí na nich...

Expedice objevuje zcela zničenou planetu, na jejímž povrchu se nachází jedna z Antických laboratoří. Antikové zde vyvíjeli vyspělejší zdroj energie než ZPM. Avšak udělali chybu a celý povrch planety byl zničen. McKay se rozhodne zdroj zprovoznit, ale během testu při nehodě jeden z vědců zemře...

Na jedné planetě se náhle zřítí wraithská stíhačka a vesničané všechny Wraithy zabijí a spálí až na jednoho. Tím je Wraithská dívka, o kterou se stará jeden z místních vesničanů. Tvrdí, že vynalezl lék, díky ketrému se již Wraithové nemusí krmit na lidech...

Mjr. Sheppard je infikován retrovirem, který by měl přeměnit Wraitha zpět na člověka, ale bohužel funguje opačně - pozměňuje lidskou DNA. Jedinou nadějí pro Shepparda jsou tak kmenové buňky z eratuských brouků, ze kterých se Wraithové vyvinuli a které musí dr. Beckett získat, aby mohl účinky retroviru zvrátit...

Senzory na Atlantidě objevují antickou válečnou loď Auroru. Při jejím průzkumu je zjištěno, že na palubě ve stázových komorách jsou stovky Antiků, kteří mezi sebou komunikují. Mjr. Sheppard se k nim připojí a zjistí, že je zde i jeden Wraith, který shromažďuje informace o Antickém hyperpohonu...